دانلود نرم افزار freesurfer به همراه آموزش


https://partoyar.com/uploads/media/لوگو سایت پرتویار
انتشار: یکشنبه, 23 آبان 0
بروزرسانی:سه شنبه, 09 آذر 0
بازدید: 39
تعداد نظرات:0
لینک کوتاه:
  دسته بندی:     هوش مصنوعی   


نرم افزار freesurfer  یک نرم افزار متن باز برای آنالیز تصاویر mri مغز است.این نرم افزار در محیط لینوکس و مک قابل ران و استفاده است. 

معرفی freesurfer

Freesurf یک ابزار برای تجزیه و تحلیل تصاویر مغز است. این نرم افزار شامل ابزارهایی برای تجزیه و تحلیل مبتنی بر حجم و سطح است. Freesurf  شامل ابزارهایی برای بازسازی مدل های توپولوژیکی درست و هندسی است.

دانلود freesurfer 

برای دانلود نرم افزار freesurfer وارد لینک زیر می شویم.

 https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/rel7downloads 

این نرم افزار را می توان روی MAC و لینوکس و ویندوز( به صورت ماشین مجازی که معادل با لینوکس است) اجرا کرد. فایل دانلود آن حدود 5 گیگ حجم دارد.

نصب در اوبونتو

برای نصب freesurfer در محیط اوبونتو باید مراحل زیر را گام به گام دنبال کنیم.

1) دانلود فایل و انتقال به محیط لینوکس

2) اکسترکت کردن فایل 

3) تعریف یک متغیر به نام FREESURFER_HOME  

این متغیر مسیر اکسترکت شده freesurfer را نشان می دهد.

4)  در درون یک فایل به نام SetUpFreeSurfer.sh وجود دارد. با استفاده از دستور source محتویات آن را اجرا می کنیم.

بعد از اجرای موفق متغییری روی ترمینال نشان می دهد. 

-------- freesurfer-linux-centos7_x86_64-7.2.0-20210720-aa8f76b --------

Setting up environment for FreeSurfer/FS-FAST (and FSL)

FREESURFER_HOME   /home/tester/freesurfer

FSFAST_HOME       /home/tester/freesurfer/fsfast

FSF_OUTPUT_FORMAT nii.gz

SUBJECTS_DIR      /home/tester/freesurfer/subjects

MNI_DIR           /home/tester/freesurfer/mni

 

در صورتی که این متغیر ها به درستی نشان داده شد، به این معنی است که نصب با موفقیت صورت گرفته است. 

5) باز کردن freeview : برای پیدا کردن و باز کردن ابزار freeview دستور which freeview در ترمینال تایپ می کنیم. بعد از این دستور مسیر قرار گرفتن freeview نمایش داده می شود.

6) باز کردن freeview :  برای باز کردن freeview اسم آن را در مسیری که قرار دارد تایپ می کنیم و ابزار باز می شود. 

 

$ cd $HOME

$ pwd

/home/tester

$ tar -zxpf freesurfer-linux-centos7_x86_64-7.2.0.tar.gz

<wait for command to finish>

 

$ cd freesurfer

$ pwd

/home/tester/freesurfer

$ export FREESURFER_HOME=$HOME/freesurfer

$ source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh

-------- freesurfer-linux-centos7_x86_64-7.2.0-20210720-aa8f76b --------

Setting up environment for FreeSurfer/FS-FAST (and FSL)

FREESURFER_HOME   /home/tester/freesurfer

FSFAST_HOME       /home/tester/freesurfer/fsfast

FSF_OUTPUT_FORMAT nii.gz

SUBJECTS_DIR      /home/tester/freesurfer/subjects

MNI_DIR           /home/tester/freesurfer/mni

 

$ which freeview

/home/tester/freesurfer/bin/freeview

 

فعالسازی و درخواست لایسنس

بعد از نصب نرم افزار باید لایسنس آن را تهیه کنید. برای تهیه لایسنس به سایت آن مراجعه می کنید و درخواست ارسال می کنید. فایل لایسنس برای شما ایمیل می شود. این فایل به صورت یک فایل متنی است که باید درون پوشه freesurfer قرار گیرد.

باز کردن freeview

باز کردن freeview :  برای باز کردن freeview اسم آن را در مسیری که قرار دارد تایپ می کنیم و ابزار باز می شود. 

 

دانلود متن به صورت pdf
  برچسب ها :    



محدودیت در دسترسی

برای مشاهده کامل این قسمت وارد سایت شوید

ورود عضویت

  شبکه های اجتماعی

در شبکه اجتماعی اینستاگرام هر روز تخفیف داریم. آکادمی پرتویار در اینستاگرام دنبال کنید تا در جریان این تخفیف ها قرار بگیرید

گروه تلگرامی مونت کارلو با بیش از 400 عضو مخصوص پاسخ به سوالات شما عزیزان است

در واتس آپ به گروه پشتیبان ما بپیوندید

میخوای در برنامه نویسی حرفه ای بشی؟ کلیک کن

  جستجو

جستجو پیشرفته

برای مشاوره، سفارش پروژه، کارگاه و ... با شماره 09372846654 تماس بگیرید

  پنل کاربری

ورود عضویت


  دسته بندی


52.205.167.104
fa