آموزش فریم ورک مونت کارلو Gate

image

آموزش فریم ورک مونت کارلو Gate

فصل اول: مقدمه 
1) نویسندگان
2) لیست ایمیل های گیت
3) پیشگفتار
4) موسسات همکار
5) چشم انداز کلی
فصل دوم: شروع به کار
ظاهر کاربری- زبان ماکرو
گام اول: تعریف هندسه اسکنر
گام دوم : تعریف هندسه فانتوم
گام سوم: چیدمان فرآیند های فیزیکی
گام چهارم: راه اندازی
گام پنجم: راه اندازی دیجیتایزر
گام ششم: راه اندازی چشمه
گام هفتم: تعریف داده های خروجی
گام هشتم: شروع جمع آوری
تقریب زمانی منظم
اسلایس با زمان متغیر
 
فصل سوم: تعریف هندسه
2) ایجاد یک حجم
کلیات-ایجاد درخت
واحد ها
محور ها
ساخت یک حجم
ساخت حجم جدید
تعریف اندازه
تعریف ماده
تعریف یک رنگ
توصیف حجم
Figure .: When a wedge is inserted, it is oriented as shown in this figure
) تکرار حجم
تکرار خطی
Ring repeater
تکرار آرایه مکعبی
Quadrant repeater
تکرار کروی
Generic repeater
تعیین مکان حجم
) انتقال حجم
Rotation
Alignment
حرکت دادن حجم
انتقال
چرخش
Orbiting
Wobbling
Eccentric rotation
Generic move
Generic repeater move
) بروزرسانی هندسه
فصل چهارم: مواد
) دیتابیس مواد گیت
عنصر ها
مواد
) اصلاح دیتابیس مواد گیت
عنصر جدید
ماده جدید
عنصر ها به عنوان ماده
ترکیبات  به عنوان ماده
مخلوط ها به عنوان ماده
مخلوطی از مواد  به عنوان ماده
) پتانسیل یونش
فصل پنجم: راه اندازی فیزیک
) مکانیزم فیزیک لیست جدید
) انتخاب فیزیک لیست
) ذرات
) اضافه کردن یک فرآیند
) از بین بردن یک فرآیند
) مدل ها و دیتاست ها
) فرآیند های فیزیکی
فرآیند های الکترو مغناطیسی
اثر فوتو الکتریک
پراکندگی کامپتون
پراکندگی رایلی
تولید زوج
یونش
تابش برمشترالونگ
نابودی الکترون و پوزیترون
پراکندگی های یگانه و چند گانه
فرآیند های الکترومغناطیسی میون
انتخاب های الکترومغناطیسی
فرآیند های هادرونی
) ماژول های اصلی جینت
LHEP
آبشارBertini
آبشار باینری
پراکندگی کشسان
) فرآیند های غیر الاستیک پروتون
فرآیند های غیر الاستیک یون ها
نوترون ها
گیر اندازی رادیو اکتیو
پراکندگی ناکشسان
شکافت
واپاشی ذرات
واپاشی رادیو اکتیو
) فرآیند های فیزیک اپتیکی
جذب حجمی
پراکندگی رایلی
پراکندگی مای
Processes at Boundaries
Wavelength Shifting or Fluorescence
) میدان مغناطیسی
فصل ششم: برش و روش کاهش واریانس
Production threshold, step limiter and special cuts
آستانه تولید
برش تابش ایکس و الکترون های اوژه در فرآیند های فوتو الکتریک
محدود کننده گام ها
برش های مخصوص
کاهش واریانس
برش ها و روش رولت روسی
برش ها
روش رولت روسی
انتخاب روش های برشی و رولت روسی
تخمین زنند های طول مسیر ( TLE and seTLE )
 
فصل هفتم: چشمه ها
) GPS ( نوع ذرات کلی )
) ساخت چشمه
اضافه کردن چشمه
اضافه کردن نوع چشمه
چشمه های یونی
چشمه های ساده
کلمات کلیدی کمک کننده
تعریف اکتویته
) تعریف انرژی
) توزیع انرژی
) مقدار انرژی
) مثال ها
تعریف توزیع زاویه ای چشمه
تعریف شکل چشمه
تعریف مکان چشمه
حرکت چشمه
اتصال دادن به حجم
محدود کردن چشمه
تعریف یک چشمه سرد
مشاهده هندسه
شدت
چشمه های مدادی
TPS  چشمه های مدادی
چشمه یوتریم سریع
فصل هشتم: وکسل بندی چشمه و فانتوم
مقدمه
Voxelized phantoms
فصل نهم: اجرا یک برنامه گیت
فصل دهم: مشاهده هندسه در گیت
مقدمه
نکات مهم
دستورات
مشاهده هندسه با OpenGL
مشاهده تصاویر
Immediate mode
Stored mode
مشاهده با  DAWN
مشاهده با  VRML
محورها
فصل یازدهم: کتاب شناسی
فصل دوازدهم: ساختار شبیه سازی در گیت
اصول کلی
اضافه گویی و مشاهده هندسه
توضیح نویسی
داده ای خروجی
خروجی های استاندارد
خروجی های ویژه
آزمایش ها
تولید کننده های رندوم
مثالی از اسکنر  PET
برهمکنش های مهم
فصل سیزدهم: تعریف یک هندسه
Ecat
Description
Use
Use
OPET
Description
Use
SPECTHead
Description
Use
OpticalSystem
فصل چهاردهم: پیوست آشکارساز های حساس
فصل پانزدهم: دیجیتایزر  و پارامتر های قرائت
هدف های کلی
From particle detection to coincidences in GATE
Definition of a hit in Geant
Role of the digitizer
Disabling the digitizer
Digitizer modules
Distributions
Definition
Usage
Adder
Definition
Command line
Adder Compton
Definition
Command line
Readout
Definition
Command line
Example
The setDepth command line
Energy blurring
Definition
Command line
Crystal blurring for a block detector
Command line
Local energy blurring for a detector module with several types of crystals
Command line
Calibration
Command line
Crosstalk
Definition
Command line
Thresholder & Upholder
Energy windows
Sigmoidal thresholder
Time resolution
Spatial blurring for SPECT
Spatial blurring for PET
Noise
Local efficiency
Memory buffers and bandwidth
Pile-up
Multiple processor chains
Coincidence sorter
Coincidence processing and filtering
Multiple coincidence removal
Command line
Example of a digitizer setting
Digitizer optimization
Use of the ARF tables
Multi-system approaches: how to use more than one system in one simuation set-up ?
فصل شانزدهم: داده های خروجی
) خروجی  ASCII
Introduction
How to enable this output in your macro?
How to disable this output in your macro?
Description of the ASCII file content
Hits file (gateHits.dat)
) خروجی Binary
) خروجی فایل روت
چگونه این خروجی را در فایل ماکرو فعال کنیم؟
چگونه خروجی روت را در فایل خروجی غیر فعال کنیم؟
چگونه فایل های روت را با هم ترکیب کنیم؟
چگونه خروجی فایل های روت را آنالیز کنیم؟
چگونه فایل روت را به یک فایل متنی برای تحلیل های بیشتر تبدیل کنیم؟
رسم کننده آنلاین فایل روت
) Interfile output of projection set
توصیف
Use
) خروجیSinogram
) خروجیEcat
راه اندازی
فایل سینوگرام
معرفی
استفاده
محدودیت ها
) خروجی تصاویر  CT
فصل هفدهم: تولید و رد دیابی ذرات فوتون
کتاب شناسی
فصل هجدهم: ساختار شبیه سازی رادیوتراپی
اصول کلی
فصل نوزدهم: قرائت پارامتر ها برای رادیو تراپی
اهداف کلی
اضافه کردن اکتور
اتصال حجم
ذخیره کردن خروجی
D matrix actor (Image actor)
Actor list
Simulation statistic
Electromagnetic (EM) properties
Dose measurement
طیف انرژی
Production and stopping particle position
Secondary production
Delta kinetic energy
Number of particles entering volume
Q-value
CrossSectionProductionActor
فصل بیستم: مفهوم فضای فازی
چگونه یک فضای فازی ایجاد کنیم؟
چگونه از فضای فازی استفاده کنیم؟
GateRT
فصل بیست و یک:  نحوه استفاده از کلاستر برای Gate
Installation of the job splitter (gjs)
Installation of the file merger (gjm)
Preparing your macro
Using the job splitter
Using the file merger
Alternative to the file merger
What about errors?
فصل بیست و دو: استفاده از گیت روی  GPU
نصب ابزار CUDA
کاربرد های PET
کاربرد های CT
کاربرد های نوری